明治22年(1889)に国の特別輸出港に指定されると、5品目(米、麦、麦粉、石炭、硫黄)が輸出され、貨物の一大集散地となりました。特に石炭は、三池炭鉱より本港に運ばれ、大型蒸気船に積み替え中国上海へ輸出されています。海上交通の要地として繁栄するとともに宇土郡役所や三角裁判所が設置され、宇土地域の行政や司法の中心地でした。
世界文化遺産『明治日本の産業革命遺産』の構成資産の1つです。
この碑は、自然石を舟に、十字架を帆柱に見立ててデザインされているそうです。
寛永14年(1637)の島原・天草一揆で一揆勢から二度に亘って総攻撃を受けましたが落城しませんでした。
寛永15年(1638)に山崎家治が領主となり、寛永18年(1641)から天領となりました。
寛文4年(1664)に戸田忠昌が入城し再び富岡藩が立藩しましたが、城の維持管理が領民への負担を強いているので忠昌は、寛文10年(1670)に三の丸に藩庁を残し、本丸・二の丸を破却し廃城としました。これは"戸田の破城"と呼ばれています。
寛文11年(1671)に再び天領となり、富岡城三の丸は明治維新まで天草代官所として機能しました。
